发票遗失后，退学仍有可能退回已交学费。分析说明：根据《高等教育法》及《学费收退费管理办法》的相关规定，学校应按学生实际学习时间退费。发票虽为重要凭证，但并非唯一依据。若发票遗失，可依据其他证明材料如缴费记录等申请退费。学校若拒绝退费，则可能损害学生合法权益。提醒：若学校以发票遗失为由拒绝退费，且双方协商无果，问题变得比较严重，应及时寻求法律途径解决。
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处理方式：从法律角度看，发票遗失后申请退费的处理方式主要包括：1.与学校财务部或教务处联系，说明情况并尝试补办发票或获取其他证明材料。2.若学校不配合，可向校长办公室投诉，或准备相关证据向当地教育局提出申诉。3.咨询法律专业人士，了解自己的权益和可行的解决方案，必要时可通过法律途径维护自身权益。选择建议：应优先考虑与学校协商，若协商无果再采取其他措施。同时，保留好所有相关证据和凭证，以便在需要时能够提供证明。
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具体操作：从法律角度，针对发票遗失后申请退费的问题，在不同情况下可采取以下具体操作：1.若学校有明确退费政策且符合政策规定的退款条件，即使发票遗失，也可直接依据政策申请退款。2.若双方之间有书面合同或协议，并且合同中约定了退款相关条款，则依据合同约定执行退款流程，发票的缺失可能不会对退款产生实质性影响。3.若既没有明确的退费政策，也没有书面合同约定退款相关事宜，则应与学校协商解决。协商时，可提供缴费记录等其他证明材料。若协商无果，可向校长办公室投诉或向教育局申诉，必要时可通过法律途径解决争议。在整个过程中，务必保留好所有相关证据和凭证。